Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
DOI:
https://doi.org/10.15359/ru.36-1.31Palabras clave:
Taenia solium, cisticercosis, proteínas recombinantes, empalme trans, líder empalmado, PCRResumen
Los cisticercos de Taenia solium causan cisticercosis, y la neurocisticercosis (NCC) es la principal patología. La caracterización de genes es fundamental para el conocimiento de la biología del parásito, la relación parásito-hospedador y la identificación de posibles dianas de diagnóstico, tratamiento y protección. El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y bioinformática, de tres ADN complementarios (ADNc) (TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8), obtenidos por cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium. Las secuencias se compararon con las de las bases de datos de ácidos nucleicos y proteínas (GenBank, EMBL) y se analizaron mediante programas bioinformáticos (CDD-Search del Centro Nacional de Información Biotecnológica, Interpro del Instituto Europeo de Bioinformática, Motif scan y Sistema de Análisis de Proteínas del Instituto Suizo de Bioinformatica). Teniendo en cuenta las altas identidades con moléculas similares de helmintos relacionados (Taenia asiatica, Echinococcus granulosus, E. multilocularis e Hymenolepis diminuta) y los dominios funcionales encontrados, los genes de Taenia, TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8 podrían actuar como un factor de transcripción nuclear gamma, una supuesta proteína asociada a ATPasa vacuolar de membrana y una proteína activadora de Rho GTPasa, respectivamente. Aunque pocos epítopos B pudieron predecirse en las secuencias, podría ser relevante valorarlos como posibles candidatos para diagnóstico y protección en cisticercosis. La caracterización y análisis de estas secuencias y la predicción de su posible utilidad como antígenos, vacunas o dianas terapéuticas ayudan al diseño y planificación de estudios futuros.
Referencias
Artimo, P., Jonnalagedda, M., Arnold, K., Baratin, D., Csardi, G., de Castro, E, ...& Stockinger, H. (2012). ExPASy: SIB bioinformatics resource portal. Nucleic Acids Research, 40, W597-W603. https://doi.org/10.1093/nar/gks400
Boratyn, G.M., Thierry-Mieg, J., Thierry-Mieg, D., Busby, B. & Madden, T. L. (2019). Magic-BLAST, an accurate RNA-seq aligner for long and short reads. BMC Bioinformatics, 20, 405. https://doi.org/10.1186/s12859-019-2996-x
Brehm, K., Jensen, K. & Frosch, M. (2000). mRNA trans-splicing in the human parasitic céstodes Echinococcus multilocularis. Journal of Biological Chemistry, 275, 38311-38318. http://doi.org/10.1074/jbc.M006091200
Brehm, K., Hubert, K., Sciutto E., Gárate, T. & Frosch, M. (2002). Characterization of a spliced leader gene and of trans-spliced mRNAs from Taenia solium. Molecular and Biochemical Parasitology, 122, 105-110. http://doi.org/10.1016/s0166-6851(02)00074-9
Chen, H. & Franklin Pugh, B. (2021). What do transcription factors interact with? Journal of Molecular Biology, 2021, 166883. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2021.166883
Cook R, Carvalho-Queiroz, C., Wilding, G. & LoVerde, P. (2004). Nucleic Acid Vaccination with Schistosoma mansoni Antioxidant Enzyme Cytosolic Superoxide Dismutase and the Structural Protein Filamin Confers Protection against the adult Worm Stage. Infection and Immunity, 72, 6112-6124. https://doi.org/10.1128/IAI.72.10.6112-6124.2004
Ferrer, E. & Gárate, T. (2014). Taeniosis and Cysticercosis. In F. Bruschi (Ed), Helminth Infections and their Impact on Global Public Health (pp. 201-227). Biomedicine/Life Sciences Springer Wien. http://doi.org/10.1007/978-3-7091-1782-8_7
Garrido, O., Requena, D., Flores, C., Gárate, T. & Ferrer, E. (2012). [Spliced leader gene cloning from expression library of Taenia solium cysticerci]. Salus, 16, 13-21.
Garrido, O., Gárate, T. & Ferrer, E. (2015). [Sequences analysis of Taenia solium molecules post-transcriptionally processed by trans-splicing]. Boletín de Malariología y Salud Ambiental, 55, 41-51.
Hanley, P. J., Vollmer, V. & Bähler, M. (2020). Class IX Myosins: Motorized RhoGAP Signaling Molecules. Advances in Experimental Medicine and Biology, 1239, 381-389. https://doi.org/10.1007/978-3-030-38062-5_16
Krchňáková, Z., Krajčovič, J. & Vesteg, M. (2017). On the Possibility of an Early Evolutionary Origin for the Spliced Leader Trans-Splicing. Journal of Molecular Evolution, 85, 37-45. http://doi.org/10.1007/s00239-017-9803-y
Liu, X., Wang, C., Li, N., Zhang, X., Zheng, Y. & Cao, X. (2006). Molecular cloning and characterization of a novel V-ATPase associated protein, DVA9.2, from human dendritic cells. Life Sciences, 79, 1828–1838. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2006.06.028
Lu, S., Wang, J., Chitsaz, F., Derbyshire. M. K., Geer, R. C., Gonzales, N. R., …& Marchler-Bauer, A. (2020). CDD/SPARCLE: The Conserved Domain Database in 2020. Nucleic Acids Research, 48, D265-D268. https://doi.org/10.1093/nar/gkz991
Mitchell, A. L., Attwood, T. K., Babbitt, P. C., Blum, M., Bork, P., Bridge, A., … & Finn, R.D. (2019). InterPro in 2019: improving coverage, classification and access to protein sequence annotations. Nucleic Acids Research, 47, D351–D360. https://doi.org/10.1093/nar/gky1100
Morillo, M., Noguera, C., Gallego, L., Fernández, Z., Mata M., Khattar, S., …& Ferrer, E. (2020). Characterization and evaluation of three new recombinant antigens of Taenia solium for the immunodiagnosis of cysticercosis. Molecular and Biochemical Parasitology, 240, 111321. https://doi.org/10.1016/j.molbiopara.2020.111321
Pan American Health Organization (PAHO/WHO). (2019). Operational guidelines for taeniasis and cysticercosis control activities caused by Taenia solium. Contribution to the control of Taenia solium in Latin America and the Caribbean. PAHO. https://iris.paho.org/handle/10665.2/51660
Saha, S., Bhasin, M. & Raghava, G.P.S. (2005). Bcipep: A database of B-cell epitopes. BMC Genomics, 6, 79. https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-79
Sather, S. & Agabian, N. (1985). A 5`spliced leader is added in trans to both α- and β-tubulin transcripts in Trypanosoma brucei. Proceedings of the National Academy of Sciences, 82, 5695-5699. http://doi.org/10.1073/pnas.82.17.5695
Tsai, I. J., Zarowiecki, M., Holroyd, N., Garciarrubio, A., Sanchez-Flores, A., Brooks, K. L., … & Berriman, M. (2013). The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism. Nature, 496, 57-63. https://doi.org/10.1038/nature12031
World Health Organization (WHO). (2021). Taeniasis/cysticercosis Fact Sheet, https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/taeniasis-cysticercosis
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