Caracterización de tres ADNc obtenidos mediante cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium
DOI:
https://doi.org/10.15359/ru.36-1.31Palabras clave:
Taenia solium, cisticercosis, proteínas recombinantes, empalme trans, líder empalmado, PCRResumen
Los cisticercos de Taenia solium causan cisticercosis, y la neurocisticercosis (NCC) es la principal patología. La caracterización de genes es fundamental para el conocimiento de la biología del parásito, la relación parásito-hospedador y la identificación de posibles dianas de diagnóstico, tratamiento y protección. El objetivo de este trabajo fue la caracterización molecular y bioinformática, de tres ADN complementarios (ADNc) (TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8), obtenidos por cribado por PCR de una genoteca de Taenia solium. Las secuencias se compararon con las de las bases de datos de ácidos nucleicos y proteínas (GenBank, EMBL) y se analizaron mediante programas bioinformáticos (CDD-Search del Centro Nacional de Información Biotecnológica, Interpro del Instituto Europeo de Bioinformática, Motif scan y Sistema de Análisis de Proteínas del Instituto Suizo de Bioinformatica). Teniendo en cuenta las altas identidades con moléculas similares de helmintos relacionados (Taenia asiatica, Echinococcus granulosus, E. multilocularis e Hymenolepis diminuta) y los dominios funcionales encontrados, los genes de Taenia, TsTF10, TsAAP8 y TsrGAP8 podrían actuar como un factor de transcripción nuclear gamma, una supuesta proteína asociada a ATPasa vacuolar de membrana y una proteína activadora de Rho GTPasa, respectivamente. Aunque pocos epítopos B pudieron predecirse en las secuencias, podría ser relevante valorarlos como posibles candidatos para diagnóstico y protección en cisticercosis. La caracterización y análisis de estas secuencias y la predicción de su posible utilidad como antígenos, vacunas o dianas terapéuticas ayudan al diseño y planificación de estudios futuros.
Referencias
Artimo, P., Jonnalagedda, M., Arnold, K., Baratin, D., Csardi, G., de Castro, E, ...& Stockinger, H. (2012). ExPASy: SIB bioinformatics resource portal. Nucleic Acids Research, 40, W597-W603. https://doi.org/10.1093/nar/gks400
Boratyn, G.M., Thierry-Mieg, J., Thierry-Mieg, D., Busby, B. & Madden, T. L. (2019). Magic-BLAST, an accurate RNA-seq aligner for long and short reads. BMC Bioinformatics, 20, 405. https://doi.org/10.1186/s12859-019-2996-x
Brehm, K., Jensen, K. & Frosch, M. (2000). mRNA trans-splicing in the human parasitic céstodes Echinococcus multilocularis. Journal of Biological Chemistry, 275, 38311-38318. http://doi.org/10.1074/jbc.M006091200
Brehm, K., Hubert, K., Sciutto E., Gárate, T. & Frosch, M. (2002). Characterization of a spliced leader gene and of trans-spliced mRNAs from Taenia solium. Molecular and Biochemical Parasitology, 122, 105-110. http://doi.org/10.1016/s0166-6851(02)00074-9
Chen, H. & Franklin Pugh, B. (2021). What do transcription factors interact with? Journal of Molecular Biology, 2021, 166883. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2021.166883
Cook R, Carvalho-Queiroz, C., Wilding, G. & LoVerde, P. (2004). Nucleic Acid Vaccination with Schistosoma mansoni Antioxidant Enzyme Cytosolic Superoxide Dismutase and the Structural Protein Filamin Confers Protection against the adult Worm Stage. Infection and Immunity, 72, 6112-6124. https://doi.org/10.1128/IAI.72.10.6112-6124.2004
Ferrer, E. & Gárate, T. (2014). Taeniosis and Cysticercosis. In F. Bruschi (Ed), Helminth Infections and their Impact on Global Public Health (pp. 201-227). Biomedicine/Life Sciences Springer Wien. http://doi.org/10.1007/978-3-7091-1782-8_7
Garrido, O., Requena, D., Flores, C., Gárate, T. & Ferrer, E. (2012). [Spliced leader gene cloning from expression library of Taenia solium cysticerci]. Salus, 16, 13-21.
Garrido, O., Gárate, T. & Ferrer, E. (2015). [Sequences analysis of Taenia solium molecules post-transcriptionally processed by trans-splicing]. Boletín de Malariología y Salud Ambiental, 55, 41-51.
Hanley, P. J., Vollmer, V. & Bähler, M. (2020). Class IX Myosins: Motorized RhoGAP Signaling Molecules. Advances in Experimental Medicine and Biology, 1239, 381-389. https://doi.org/10.1007/978-3-030-38062-5_16
Krchňáková, Z., Krajčovič, J. & Vesteg, M. (2017). On the Possibility of an Early Evolutionary Origin for the Spliced Leader Trans-Splicing. Journal of Molecular Evolution, 85, 37-45. http://doi.org/10.1007/s00239-017-9803-y
Liu, X., Wang, C., Li, N., Zhang, X., Zheng, Y. & Cao, X. (2006). Molecular cloning and characterization of a novel V-ATPase associated protein, DVA9.2, from human dendritic cells. Life Sciences, 79, 1828–1838. https://doi.org/10.1016/j.lfs.2006.06.028
Lu, S., Wang, J., Chitsaz, F., Derbyshire. M. K., Geer, R. C., Gonzales, N. R., …& Marchler-Bauer, A. (2020). CDD/SPARCLE: The Conserved Domain Database in 2020. Nucleic Acids Research, 48, D265-D268. https://doi.org/10.1093/nar/gkz991
Mitchell, A. L., Attwood, T. K., Babbitt, P. C., Blum, M., Bork, P., Bridge, A., … & Finn, R.D. (2019). InterPro in 2019: improving coverage, classification and access to protein sequence annotations. Nucleic Acids Research, 47, D351–D360. https://doi.org/10.1093/nar/gky1100
Morillo, M., Noguera, C., Gallego, L., Fernández, Z., Mata M., Khattar, S., …& Ferrer, E. (2020). Characterization and evaluation of three new recombinant antigens of Taenia solium for the immunodiagnosis of cysticercosis. Molecular and Biochemical Parasitology, 240, 111321. https://doi.org/10.1016/j.molbiopara.2020.111321
Pan American Health Organization (PAHO/WHO). (2019). Operational guidelines for taeniasis and cysticercosis control activities caused by Taenia solium. Contribution to the control of Taenia solium in Latin America and the Caribbean. PAHO. https://iris.paho.org/handle/10665.2/51660
Saha, S., Bhasin, M. & Raghava, G.P.S. (2005). Bcipep: A database of B-cell epitopes. BMC Genomics, 6, 79. https://doi.org/10.1186/1471-2164-6-79
Sather, S. & Agabian, N. (1985). A 5`spliced leader is added in trans to both α- and β-tubulin transcripts in Trypanosoma brucei. Proceedings of the National Academy of Sciences, 82, 5695-5699. http://doi.org/10.1073/pnas.82.17.5695
Tsai, I. J., Zarowiecki, M., Holroyd, N., Garciarrubio, A., Sanchez-Flores, A., Brooks, K. L., … & Berriman, M. (2013). The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism. Nature, 496, 57-63. https://doi.org/10.1038/nature12031
World Health Organization (WHO). (2021). Taeniasis/cysticercosis Fact Sheet, https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/taeniasis-cysticercosis
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Los autores que publican en esta revista están de acuerdo con los siguientes términos:
1. Los autores garantizan a la revista el derecho de ser la primera publicación del trabajo al igual que licenciado bajo una Creative Commons Attribution License que permite a otros compartir el trabajo con un reconocimiento de la autoría del trabajo y la publicación inicial en esta revista.
2. Los autores pueden establecer por separado acuerdos adicionales para la distribución no exclusiva de la versión de la obra publicada en la revista (por ejemplo, situarlo en un repositorio institucional o publicarlo en un libro), con un reconocimiento de su publicación inicial en esta revista.
3. Los autores han afirmado poseer todos los permisos para usar los recursos que utilizaron en el artículo (imágenes, tablas, entre otros) y asumen la responsabilidad total por daños a terceros.
4. Las opiniones expresadas en el artículo son responsabilidad de los autores y no necesariamente representan la opinión de los editores ni de la Universidad Nacional.
Revista Uniciencia y todas sus producciones se encuentran bajo una Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Unported.
No existe costo por acceso, revisión de propuestas ni publicación para autores y lectores.
