Aislamiento e identificación del virus pandémico influenza H1N1/2009 S-OIV en cerdos de explotaciones comerciales y de traspatio en Costa Rica
Palabras clave:
Virus de la influenza, PCR tiempo real, H1N1/2009 S-OIV, porcino, cerdos, salud pública, Costa RicaResumen
Los virus de influenza representan una amenaza no solo para el comercio internacional de bienes de origen animal sino también para la salud humana. A mediados del 2009 se diagnosticó una nueva variante de la influenza H1N1/2009 S-OIV en humanos en México y Estados Unidos, la cual culminó con una declaratoria de pandemia por parte de la Organización Mundial de la Salud (OMS). Costa Rica fue el cuarto país en América en el que se demostró la presencia de esta cepa de origen porcino en seres humanos. En el 2010 la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO, por sus siglas en inglés) promovió la toma de conciencia pública en algunos países de América como Costa Rica, donde patrocinó y organizó un programa para la detección y la caracterización de la influenza H1N1 en cerdos. Con el propósito de determinar si el subtipo H1N1/2009 S-OIV circulaba en los cerdos del área, se llevó a cabo un muestreo de 509 cerdos de 25 granjas distribuidas por todas las provincias de Costa Rica. Los resultados confirmaron la presencia de este subtipo en al menos dos de las granjas analizadas. En un caso, se detectó la presencia de este virus en hisopados nasales a través del RT-PCR de tiempo real en 11 cerdos, cuyo resultado posteriormente se confirmó en cultivo celular. El segundo caso se detectó por PCR mas no pudo ser confirmado por cultivo. Los estudios filogenéticos realizados en los genes HA, NA y M de este virus muestran que la cepa aislada está estrechamente relacionada en un mismo cluster dentro de las secuencias H1N1/2009 S-OIV analizadas a nivel mundial de origen humano. Este hallazgo debe darse a conocer a los servicios de salud humana y animal tanto a nivel local como global (por ejemplo, la OMS o la OIE). Este artículo igualmente muestra la utilidad de realizar estudios de vigilancia en granjas donde interactúen aves domésticas, aves silvestres, cerdos y seres humanos, con el objetivo de mejorar la detección temprana y prevenir el esparcimiento de nuevas variantes que puedan llegar a convertirse en cepas pandémicas.
Referencias
Bi, Y., G. Fu, J. Chen, J. Peng, Y. Sun, J. Wang, J. Pu, Y. Zhang, H. Gao, G. Ma, F. Tian, I. H. Brown, J. Liu. 2010. Novel swine influenza virus reassortants in pigs, China. Emerging Infectious Diseases. 16 (7): 1162–1164. doi:10.3201/eid1607.091881
Chan, C. H., K. L. Lin, Y. Chan, Y. L. Wang, Y. T. Chi, H. L. Tu, H. K. Shieh, W. T. Liu. (2006). Amplification of the entire genome of influenza A virus H1N1 and H3N2 subtypes by reverse-transcription polymerase chain reaction. Journal of Virological Methods. 136 (1-2): 38–43. doi:10.1016/j.jviromet.2006.03.027
Di Trani, L., B. Bedini, I. Donatelli, L. Campitelli, B. Chiappini, M. A. De Marco, M. Delogu, C. Buonavoglia, G. Vaccari, G. 2006. A sensitive one-step real-time PCR for detection of avian influenza viruses using a MGB probe and an internal positive control. BMC Infectious Diseases. 6: 87. doi:10.1186/1471-2334-6-87
Dong, C., L. Ying, D. Yuan. 2011. Detecting transmission and reassortment events for influenza A viruses with genotype profile method. Virology Journal. 8: 395. doi:10.1186/1743-422X-8-395
Dotis, J. & E. Roilides. 2009. H1N1 influenza A infection. Hippokratia. 13 (3): 135–138. Retrieved from http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2765289&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
Ferrari, G., J. Pinto, N. Honhold, J. Zingeser, G. Dauphin, M. Kim, K. Dietze, J. Domenech and J. Lubroth (n.d.). FAO guidelines for surveillance of pandemic H1N1/2009 and other influenza viruses in swine populations (p. 19). Retrieved from http://www.fao.org/Ag/AGAInfo/programmes/en/empres/AH1N1/docs/h1n1_guidelines_fao.pdf
Fouchier, R. A. M., V. Munster, A. Wallensten, T. M. Bestebroer, S. Herfst, D. Smith, G. F. Rimmelzwaan, B. Olsen, A. D. M. E. Osterhaus. 2005. Characterization of a novel influenza A virus hemagglutinin subtype (H16) obtained from black-headed gulls. Journal of Virology. 79 (5): 2814–2822. doi:10.1128/JVI.79.5.2814-2822.2005
Garten, R. J., C. T. Davis, C. A. Russell, B. Shu, S. Lindstrom, A. Balish, W. M. Sessions, X. Xu, E. Skepner, V. Deyde, M. Okomo-Adhiambo, L. Gubareva, J. Barnes, C. B. Smith, S. L. Emery, M. J. Hillman, P. Rivailler, J. Smagala, M. de Graaf, D. F. Burke, R. A. M. Fouchier, C. Pappas, C. M. Alpuche-Aranda, H. López-Gatell, H. Olivera, I. López, C. A. Myers, D. Faix, P. J. Blair, C. Yu, K. M. Keene, P. David Dotson, Jr., D. Boxrud, A. R. Sambol, S. H. Abid, K. St. George, T. Bannerman, A. L. Moore, D. J. Stringer, P. Blevins, G. J. Demmler-Harrison, M. Ginsberg, P. Kriner, S. Waterman, S. Smole, H. F. Guevara, E. A. Belongia, P. A. Clark, S. T. Beatrice, R. Donis, J. Katz, L. Finelli, C. B. Bridges, M. Shaw, D. B. Jernigan, T. M. Uyeki, D. J. Smith, A. I. Klimov, N. J. Cox. 2009. Antigenic and genetic characteristics of swine-origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans. Science. 325 (5937): 197–201. doi:10.1126/science.1176225
Gibbs, A. J., J. S. Armstrong, J. C. Downie. 2009. From where did the 2009 “swine-origin” influenza A virus (H1N1) emerge? Virology Journal. 6: 207. doi:10.1186/1743-422X-6-207
Guo, Y., M. Wang, Y. Kawaoka, O. Gorman, T. Ito, T. Saito, R. G. Webster. 1992. Characterization of a new avian-like influenza A virus from horses in China. Virology. 188 (1): 245–55. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1314452
Hall, T. A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucl. Acids. Symp., 41, 95–98. Retrieved from http://jwbrown.mbio.ncsu.edu/JWB/papers/1999Hall1.pdf
Hofshagen, M., B. Gjerset, C. Er, A. Tarpai, E. Brun, B. Dannevig, T Bruheim, I. G. Fostad, B. Iversen, O. Hungnes, B. Lium. 2009. Pandemic influenza A(H1N1)v: human to pig transmission in Norway? Euro Surveillance : Bulletin Européen Sur Les Maladies Transmissibles = European Communicable Disease Bulletin, 14 (45): 1–3. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19941789
Howden, K. J., E. J. Brockhoff, F. D. Caya, L. J. McLeod, M. Lavoie, J. D. Ing, J. M. Bystrom, S. Alexandersen, J. M. Pasick, Y. Berhane, M. E. Morrison, J. M. Keenliside, S. Laurendeau, E. B. Rohonczy. 2009. An investigation into human pandemic influenza virus (H1N1) 2009 on an Alberta swine farm. The Canadian Veterinary Journal. La Revue Vétérinaire Canadienne, 50 (11): 1153–1161. Retrieved from http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2764467&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
INCIENSA, L. de V. (2010). Boletines Vigilancia de la Salud 2010. San José, Costa Rica. Retrieved from http://ns.netsalud.sa.cr/index.php/servicios-proveeduria-ms/cat_view/121-vigilancia-de-la-salud/154-boletines/195-boletines-vigilancia-de-la-salud/196-2010?limit=8&order=name&dir=ASC&start=8
Ito, T., J. N. Couceiro, S. Kelm, L. G. Baum, S. Krauss, M. R. Castrucci, I. Donatelli, H. Kida, J. C. Paulson, R. G. Webster, Y. Kawaoka, 1998. Molecular basis for the generation in pigs of influenza A viruses with pandemic potential. Journal of Virology. 72 (9): 7367–7373. Retrieved from http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=109961&tool=pmcentrez&rendertype=abstract
Karasin, A. I., S. Carman, C. W. Olsen. 2006. Identification of human H1N2 and human-swine reassortant H1N2 and H1N1 influenza A viruses among pigs in Ontario, Canada (2003 to 2005). Journal of Clinical Microbiology. 44 (3): 1123–1126. doi:10.1128/JCM.44.3.1123-1126.2006
Karasin, A. I., M. M. Schutten, L. A. Cooper, C. B. Smith, K. Subbarao, G. Anderson, A., S. Carman, C. W. Olsen. 2000. Genetic characterization of H3N2 influenza viruses isolated from pigs in North America, 1977-1999: evidence for wholly human and reassortant virus genotypes. Virus Research. 68 (1): 71–85. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10930664
Komadina, N., V. Roque, P. Thawatsupha, J. Rimando-Magalong, S. Waicharoen, E. Bomasang, P. Sawanpanyalert, M. Rivera, P. Iannello, A. C. Hurt, I. G. Barr. 2007. Genetic analysis of two influenza A (H1) swine viruses isolated from humans in Thailand and the Philippines. Virus Genes. 35 (2): 161–165. doi:10.1007/s11262-007-0097-9
Lin, Y. P., V. Gregory, M. Bennett, A. Hay. 2004. Recent changes among human influenza viruses. Virus Research. 103 (1-2): 47–52. doi:10.1016/j.virusres.2004.02.011
Lu, G., T. Rowley, R. Garten, R. O. Donis. 2007. FluGenome: a web tool for genotyping influenza A virus. Nucleic Acids Research. 35 (Web Server issue), W275–9. doi:10.1093/nar/gkm365
Murcia, P. R., J. L. N. Wood, E. C. Holmes. 2011. Genome-scale evolution and phylodynamics of equine H3N8 influenza A virus. Journal of Virology. 85 (11): 5312–5322. doi:10.1128/JVI.02619-10
Nagarajan, K., G. Saikumar, R. S. Arya, A. Gupta, R. Somvanshi, B. Pattnaik. 2010. Influenza A H1N1 virus in Indian pigs & its genetic relatedness with pandemic human influenza A 2009 H1N1. The Indian Journal of Medical Research, 132: 160–167. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20716816
Nalluswami, K., A. Nambiar, P. Lurie, M. Moll, J. Lute, O. Simwale, E. Smith, L. Sundberg, B. Seiler, S. Swanson, N. Hanshaw, C. Shultz, E. Moore, S. Richards, M. Glazier, K. Masterson, L. Hensler, C. Miller, M. Justice, S. Epperson, L. Brammer, L. Finelli, S. Trock, M. Jhung, J. Bresee, S. Lindstrom, A. Klimov, D. Jernigan, N. Cox. 2011. Swine-origin influenza A (H3N2) virus infection in two children--Indiana and Pennsylvania, July-August 2011. MMWR. Morbidity and Mortality Weekly Report. 60 (35): 1213–1215. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21900876
Ottis, K., L. Sidoli, P. A. Bachmann, R. G. Webster, M. M. Kaplan. 1982. Human influenza A viruses in pigs: isolation of a H3N2 strain antigenically related to A/England/42/72 and evidence for continuous circulation of human viruses in the pig population. Archives of Virology, 73 (2): 103–108. Retrieved from http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6184032
Penn, O., E. Privman, H. Ashkenazy, G. Landan, D. Graur, T. Pupko. 2010. GUIDANCE: a web server for assessing alignment confidence scores. Nucleic Acids Research. 38 (Web Server issue), W23–8. doi:10.1093/nar/gkq443
Pereda, A., J. Cappuccio, M. A. Quiroga, E. Baumeister, L. Insarralde, M. Ibar, R. Sanguinetti, M. L. Cannilla, D. Franzese, O. E. Escobar-Cabrera, M. I. Craig, A. Rimondi, M. Machuca, R. T. Debenedetti, C. Zenobi, L. Barral, R. Balzano, S. Capalbo, A. Risso, C. J. Perfumo. 2010. Pandemic (H1N1) 2009 outbreak on pig farm, Argentina. Emerging Infectious Diseases. 16 (2): 304–307. doi:10.3201/eid1602.091230
Schaefer, R., J. R. C. Zanella, L. Brentano, A. L. Vincent, G. A. Ritterbusch, S. Silveira, L. Caron, N. Mores. 2011. Isolation and characterization of a pandemic H1N1 influenza virus in pigs in Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira. 31 (9): 761–767. doi:10.1590/S0100-736X2011000900007
Smith, G. J. D., D. Vijaykrishna, J. Bahl, S. J. Lycett, M. Worobey, O. G. Pybus, S. K. Ma, C. L. Cheung, J. Raghwani, S. Bhatt, J. S. Malik Peiris, Y. Guan, A. Rambaut. 2009. Origins and evolutionary genomics of the 2009 swine-origin H1N1 influenza A epidemic. Nature. 459 (7250): 1122–1125. doi:10.1038/nature08182
Song, M.-S., J. H. Lee, P. N. Q. Pascua, Y. H. Baek, H. Kwon, K. J. Park, H. -W. Choi, Y. -K. Shin, J. -Y. Song, C. -J. Kim, Y. -K. Choi. 2010. Evidence of human-to-swine transmission of the pandemic (H1N1) 2009 influenza virus in South Korea. Journal of Clinical Microbiology. 48 (9): 3204–3211. doi:10.1128/JCM.00053-10
Spackman, E., D. A. Senne, T. J. Myers, L. L. Bulaga, L. P. Garber, M. L. Perdue, K. Lohman, L. T. Daum, D. L. Suarez. 2002. Development of a real-time reverse transcriptase PCR assay for type A influenza virus and the avian H5 and H7 hemagglutinin subtypes. Journal of Clinical Microbiology. 40 (9): 3256–3260. doi:10.1128/JCM.40.9.3256
Sreta, D., S. Tantawet, S. N. N. Ayudhya, A. Thontiravong, M. Wongphatcharachai, J. Lapkuntod, N. Bunpapong, R. Tuanudom, S. Suradhat, L. Vimolket, Y. Poovorawan, R. Thanawongnuwech, A. Amonsin, P. Kitikoon. 2010. Pandemic (H1N1) 2009 virus on commercial swine farm, Thailand. Emerging Infectious Diseases, 16 (10): 1587–90. doi:10.3201/eid1610.100665
Tamura, K., D. Peterson, N. Peterson, G. Stecher, M. Nei, S. Kumar. 2011. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution, 28 (10): 2731–9. doi:10.1093/molbev/msr121
Tong, S., Y. Li, P. Rivailler, C. Conrardy, D. A. A. Castillo, L. M. Chen, S. Recuenco, J. A. Ellison, C. T. Davis, I. A. York, A. S. Turmelle, D. Moran, S. Rogers, M. Shi, Y. Tao, M. R. Weil, K. Tang, L. A. Rowe, S. Sammons, X. Xu, M. Frace, K. A. Lindblade, N. J. Cox, L. J. Anderson, C. E. Rupprecht, R. O. Donis. 2012. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (11): 4269–4274. doi:10.1073/pnas.1116200109
WHO. (n.d.). El nivel de alerta de pandemia de gripe se eleva de la fase 5 a la fase 6. Retrieved from http://www.who.int/mediacentre/news/statements/2009/h1n1_pandemic_phase6_20090611/es/index.html
Zell, R., S. Motzke, A. Krumbholz, P. Wutzler, V. Herwig, R. Dürrwald. 2008. Novel reassortant of swine influenza H1N2 virus in Germany. The Journal of General Virology, 89 (Pt 1): 271–276. doi:10.1099/vir.0.83338-0
Zimmer, S. M. & D. S. Burke. 2009. Historical perspective-Emergence of influenza A (H1N1) viruses. The New England Journal of Medicine. 361 (3): 279–285. doi:10.1056/NEJMra0904322
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Licenciamiento de los artículos
Todo artículo se publicará con una licencia:
Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Costa Rica.
El acceso a esta revista es gratuito, solo se debe citar en forma completa el artículo y la revista.
Los derechos de propiedad intelectual son del autor. Una vez aceptado el artículo para su publicación el autor cede a la Revista los derechos de reproducción.
La Revista de Ciencias Veterinarias autoriza la impresión de artículos y fotocopias para uso personal. También, se promueve el uso para fines educacionales. Especialmente: instituciones podrán crear enlaces a artículos específicos que se encuentren en el servidor de la revista a fin de conformar paquetes de cursos, seminarios o como material de instrucción.
El autor puede colocar una copia de la versión definitiva en su servidor aunque se recomienda que mantenga un enlace al servidor de la revista donde está el artículo original.
Las violaciones de propiedad intelectual recaen sobre quien la realizó. No es responsable la empresa o institución que da acceso a los contenidos, ya sea porque actúa sólo como transmisora de información (por ejemplo, proveedores de acceso a Internet) o porque ofrece servicios públicos de servidores.